甲高く長い遠吠えに悩んでいます

犬の遠吠えの目的として、自分の所在を知らせたり、遠くの仲間の声に応えたり、ということが知られています。

うるさんのワンちゃん達は、長時間の留守番は週2回ということですので、これが「非日常」であるために、不安になって遠吠えをしているのではないでしょうか?

御心配の通り、単純に罰を与えても、不安が拭えなければストレスは解消されません。まずはうるさんがいつでも一緒にいられるわけではない、出かけても必ず帰ってくる、ここにいれば安心、という認識を持たせることが大切だと思います。

まずは日常的に留守番環境を作り、在宅中にもクレートで休ませるなどの練習をしてみてください。
留守番前に十分な運動をさせたり、留守中に夢中になって遊べるおもちゃを置いて行くなども不安をまぎらわせる助けになります。

短時間の留守番はできるということですので、少しずつ練習すれば克服できると思います。
頑張ってください。

うるさんの2頭のワンちゃんたちは、どのような状態でお留守番をしているのでしょうか?

もしフリーの状態かケージでお留守番をしているのなら、それぞれをクレートで留守番をさせると良いでしょう。
5〜6時間程度の留守番であれば、トイレも我慢できますので。

現在すでにクレートでお留守番をさせていて遠吠えをしてしまうのであれば、ぜひ専門家に直接見てもらってアドバイスを受けてください。

バークフリーは効果がある場合とない場合があるので、最後の手段としてあまり期待をしない方が良いと思います。
それよりも、遠吠えをしてしまう原因がなにかあるはずなので、その原因を把握して対処する方が確実に改善できます。
ただ、ここだけではその原因を見つけアドバイスすることはできないので、まずはクレートでのお留守番を試してみてください。